Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms