Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOPBP1Q92547 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC31.39■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOPBP1Q92547 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms