Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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