Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms