Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms