Protein–RNA interactions for Protein: Q709C8

VPS13C, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, humanhuman

Predictions only

Length 3,753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13CQ709C8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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VPS13CQ709C8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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VPS13CQ709C8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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VPS13CQ709C8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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VPS13CQ709C8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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VPS13CQ709C8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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VPS13CQ709C8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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VPS13CQ709C8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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VPS13CQ709C8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS13CQ709C8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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