Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BBS12Q6ZW61 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms