Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms