Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf139Q6ZV77 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms