Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ARHGAP27Q6ZUM4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP27Q6ZUM4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms