Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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