Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms