Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP170Q5SW79 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms