Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms