Protein–RNA interactions for Protein: Q30KQ7

DEFB113, Beta-defensin 113, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB113Q30KQ7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFB113Q30KQ7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFB113Q30KQ7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms