Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
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