Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms