Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MICAQ29983 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MICAQ29983 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MICAQ29983 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MICAQ29983 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MICAQ29983 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms