Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMPQ1L6U9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMPQ1L6U9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMPQ1L6U9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMPQ1L6U9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMPQ1L6U9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMPQ1L6U9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMPQ1L6U9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMPQ1L6U9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMPQ1L6U9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMPQ1L6U9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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