Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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