Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
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