Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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