Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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