Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
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