Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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