Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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