Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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