Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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