Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TROQ12816 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TROQ12816 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TROQ12816 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TROQ12816 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TROQ12816 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TROQ12816 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TROQ12816 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TROQ12816 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TROQ12816 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TROQ12816 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TROQ12816 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TROQ12816 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TROQ12816 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TROQ12816 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TROQ12816 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TROQ12816 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TROQ12816 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TROQ12816 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TROQ12816 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TROQ12816 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TROQ12816 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TROQ12816 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TROQ12816 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TROQ12816 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TROQ12816 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TROQ12816 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TROQ12816 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TROQ12816 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TROQ12816 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TROQ12816 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TROQ12816 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TROQ12816 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TROQ12816 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TROQ12816 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TROQ12816 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TROQ12816 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TROQ12816 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TROQ12816 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TROQ12816 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TROQ12816 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TROQ12816 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TROQ12816 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TROQ12816 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TROQ12816 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TROQ12816 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TROQ12816 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TROQ12816 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TROQ12816 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
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