Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
NUP160Q12769 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP160Q12769 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP160Q12769 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP160Q12769 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP160Q12769 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP160Q12769 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP160Q12769 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP160Q12769 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP160Q12769 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms