Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
HMGXB3Q12766 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
HMGXB3Q12766 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
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