Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms