Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms