Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms