Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms