Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms