Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms