Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms