Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMF1P82094 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMF1P82094 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMF1P82094 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMF1P82094 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMF1P82094 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMF1P82094 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMF1P82094 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMF1P82094 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMF1P82094 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMF1P82094 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMF1P82094 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMF1P82094 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMF1P82094 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMF1P82094 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMF1P82094 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMF1P82094 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMF1P82094 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMF1P82094 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMF1P82094 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMF1P82094 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMF1P82094 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMF1P82094 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMF1P82094 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMF1P82094 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMF1P82094 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMF1P82094 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMF1P82094 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMF1P82094 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMF1P82094 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMF1P82094 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMF1P82094 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMF1P82094 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMF1P82094 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMF1P82094 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMF1P82094 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMF1P82094 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMF1P82094 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TMF1P82094 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TMF1P82094 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMF1P82094 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMF1P82094 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMF1P82094 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMF1P82094 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMF1P82094 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMF1P82094 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMF1P82094 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMF1P82094 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMF1P82094 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMF1P82094 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMF1P82094 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMF1P82094 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMF1P82094 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMF1P82094 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMF1P82094 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMF1P82094 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMF1P82094 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMF1P82094 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMF1P82094 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMF1P82094 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMF1P82094 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMF1P82094 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMF1P82094 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMF1P82094 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMF1P82094 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMF1P82094 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMF1P82094 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMF1P82094 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMF1P82094 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMF1P82094 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMF1P82094 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMF1P82094 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMF1P82094 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMF1P82094 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms