Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBA52P62987 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms