Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms