Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRAP54198 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRAP54198 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRAP54198 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRAP54198 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRAP54198 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRAP54198 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRAP54198 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRAP54198 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRAP54198 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRAP54198 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRAP54198 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRAP54198 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRAP54198 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRAP54198 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRAP54198 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRAP54198 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRAP54198 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRAP54198 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRAP54198 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRAP54198 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRAP54198 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRAP54198 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRAP54198 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRAP54198 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRAP54198 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRAP54198 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRAP54198 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRAP54198 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRAP54198 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRAP54198 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRAP54198 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRAP54198 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRAP54198 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRAP54198 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRAP54198 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRAP54198 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRAP54198 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRAP54198 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRAP54198 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRAP54198 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRAP54198 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRAP54198 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRAP54198 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRAP54198 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRAP54198 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRAP54198 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRAP54198 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRAP54198 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRAP54198 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRAP54198 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRAP54198 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRAP54198 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRAP54198 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms