Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP153P49790 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP153P49790 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP153P49790 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP153P49790 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP153P49790 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP153P49790 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP153P49790 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP153P49790 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP153P49790 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP153P49790 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP153P49790 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP153P49790 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP153P49790 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP153P49790 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP153P49790 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP153P49790 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP153P49790 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP153P49790 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP153P49790 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP153P49790 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP153P49790 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP153P49790 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP153P49790 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP153P49790 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP153P49790 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP153P49790 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP153P49790 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP153P49790 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP153P49790 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP153P49790 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP153P49790 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP153P49790 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP153P49790 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP153P49790 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP153P49790 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP153P49790 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP153P49790 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP153P49790 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP153P49790 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP153P49790 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP153P49790 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP153P49790 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP153P49790 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP153P49790 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP153P49790 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP153P49790 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP153P49790 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP153P49790 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP153P49790 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP153P49790 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP153P49790 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP153P49790 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP153P49790 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP153P49790 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP153P49790 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP153P49790 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP153P49790 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP153P49790 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP153P49790 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP153P49790 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP153P49790 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP153P49790 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP153P49790 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP153P49790 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP153P49790 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP153P49790 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP153P49790 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP153P49790 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP153P49790 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP153P49790 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP153P49790 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP153P49790 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP153P49790 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP153P49790 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP153P49790 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP153P49790 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP153P49790 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP153P49790 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP153P49790 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP153P49790 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP153P49790 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NUP153P49790 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NUP153P49790 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NUP153P49790 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP153P49790 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP153P49790 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP153P49790 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP153P49790 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP153P49790 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP153P49790 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP153P49790 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP153P49790 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP153P49790 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP153P49790 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NUP153P49790 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP153P49790 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP153P49790 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP153P49790 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NUP153P49790 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms