Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP5P45974 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP5P45974 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP5P45974 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP5P45974 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP5P45974 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP5P45974 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP5P45974 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP5P45974 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP5P45974 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP5P45974 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP5P45974 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP5P45974 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP5P45974 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP5P45974 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP5P45974 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP5P45974 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP5P45974 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP5P45974 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP5P45974 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP5P45974 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP5P45974 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP5P45974 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP5P45974 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP5P45974 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP5P45974 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP5P45974 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP5P45974 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP5P45974 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP5P45974 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP5P45974 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP5P45974 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP5P45974 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP5P45974 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP5P45974 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP5P45974 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP5P45974 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP5P45974 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP5P45974 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP5P45974 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP5P45974 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP5P45974 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP5P45974 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP5P45974 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP5P45974 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP5P45974 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP5P45974 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP5P45974 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP5P45974 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP5P45974 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms