Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRATP43155 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CRATP43155 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CRATP43155 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CRATP43155 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CRATP43155 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CRATP43155 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRATP43155 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRATP43155 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRATP43155 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRATP43155 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRATP43155 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRATP43155 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRATP43155 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRATP43155 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CRATP43155 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRATP43155 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRATP43155 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRATP43155 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRATP43155 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRATP43155 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRATP43155 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRATP43155 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRATP43155 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRATP43155 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRATP43155 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRATP43155 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms