Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms