Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCD1P33897 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms