Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms