Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTX2P32243 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTX2P32243 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
OTX2P32243 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
OTX2P32243 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
OTX2P32243 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
OTX2P32243 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTX2P32243 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms