Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms